短程分子蒸餾設備被應用于食品工業，主要用于混合油脂的分離。可獲得單脂肪酸甘油酯。從蒸餾液面上將單甘酯分子蒸發出來后進行冷卻實現分離。
　　利用短程分子蒸餾設備可將未反應的甘油、單甘酯依次分離出來。單甘酯即甘油一酸酯，它是重要的食品乳化劑。單甘酯的用量目前占食品乳化劑用量的三分之二。在商品中它可起到乳化、起酥、蓬松、保鮮等作用，可作為餅干、面包、糕點、糖果等食品添加劑。單甘酯可采用脂肪酸與甘油的酯化反應和油脂與甘油的醇解反應兩種工藝制取，其原料為油脂、脂肪酸和甘油。
　　分子蒸餾工藝是目前工業上生產單甘酯方法中常用的方法，所獲得的單甘酯達到食品要求。分子蒸餾單甘酯產品以質取勝，逐漸代替了純度低、色澤深的普通單甘酯，開發分子蒸餾單甘酯可為企業帶來很大的利潤。